蛋白组学GO分析图素材教程，蛋白组学数据看不懂

非模式生物GO、KEGG富集分析

KEGG指的是京都基因与基因组百科全书，通常我们使用KEGG中的pathway模块，将基因映射到某些通路上，了解基因参与生物体中的代谢过程等。

Gokegg富集分析是一种生物信息学工具，用于分析一组基因在细胞、组织或生物体中是否具有共同的生物学功能或通路。它可以将不同基因集之间的差异性比较和功能注释结果整合起来，进而预测哪些生物学过程与不同基因集相关联。

KEGG分析是通过对基因的表达信息进行分析来确定基因的功能的。GO分析和KEGG分析的主要区别在于它们所依据的数据不同。GO分析是基于序列信息的，而KEGG分析是基于表达信息的。

在是否需要构建的问题上，我看到徐洲更在 功能注释后如何做富集分析 中提到 “你不需要构建Orgdb，因为Orgdb的用途是进行基因编号和GO/KEGG的转换。

go富集分析是什么意思如下：富集分析(Enrichment Analysis) 是一种广泛应用于 生物信息学Q 研究的统计方法，主要用于检验一个基因集合中某些功能或特征的富集程度。

蛋白质组学数据分析笔记说明

1、建立了基于QE，Fusion的DIA数据采集以及数据分析流程，实现了7500个蛋白的DIA定量分析。

2、大伙儿都知道，蛋白质组学(proteomics)，是研究一种细胞或者一种生物体所表达的全部蛋白质。

3、最后这些蛋白质就可以在质谱系统中进行分析，从而得到蛋白质的定性数据；这些数据可以用于构建数据库或和已有的数据库进行比较分析。

4、实验设计建议 （1）方案一 —— 蛋白质组学+差异蛋白表达量验证 该思路是目前3~5分期刊中最常见的，也是最基础的一种研究思路。

5、蛋白质组学检测原理就是应用特定结合生物标志物的抗体快速准确的分析蛋白质组的标志物，在玻璃芯片上监测结果会发出荧光信号，信号的强弱就代表与疾病状态相关的数据。

蛋白质组学得到的差异蛋白怎么分析

1、功能鉴定：对差异蛋白的生物学功能进行深入研究，如其在细胞中的作用、调控网络等。疾病相关性研究：探讨差异蛋白在特定疾病或生理过程中的角色。例如，某些差异蛋白可能与某种疾病的发病机制、预后或治疗响应性有关。

2、在应用2D-PAGE研究差异蛋白质组学问题时首先要获得要进行差异比较的组织，如肿瘤组织与癌旁正常组织，然后裂解组织和细胞，抑制蛋白酶活性，出去非蛋白质的DNA，RNA，脂类等物质，溶解蛋白质，溶解并抽提总蛋白质。

3、质谱分析：质谱分析是针对蛋白质序列的高精度分析方法，可以通过荧光染色、同位素标记或者同位素标记配合液相色谱分离，再经过质谱检测来实现差异蛋白的筛选。

4、分子)的关系。因此蛋白质组学的研究通常是高通量的。

5、人工验证，输出报告。2 蛋白混合物的鉴定用于鉴定含多种蛋白的混合物，根据样品的复杂程度采取不同的策略分离后再进行质谱鉴定。

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