windowslammps的简单介绍

如何在lammps中实现将分子的运动固定在某个区域

在windows下也可以运行，不过好像不能做并行计算了，在windows下用DOS就可以用了，在LAMMPS Windows serial executable ，会得到一个lmp_win_no-mpi.exe，我将它放在e：\lammps下。

在Gromacs中通过设置pcoupltype=semiisotropic实现[9]，而在LAMMPS中可使用fix npt 命令中分别指定x，y，z方向的参数并指定couple xy 实现。[10] Nosé-Hoover控温和控压算法并不是万能的。

LAMMPS是专门做分子动力学（MD）模拟的程序。它跟蒙卡完全是两种截然不同的方法。

LAMMPS是根据不同的边界条件和初始条件对通过短程和长程力相互作用的分子，原子和宏观粒子集合对它们的牛顿运动方程进行积分。高效率计算的LAMMPS通过采用相邻清单来跟踪他们邻近的粒子。

但是如果确实有别的研究组能够用lammps做水分子仿真的话，说明必须得找到一种好的水分子势能场及参数。

如果是只是为了建立一个模型的话（region不会在其他命令中用到），那么可以自己写一个读入文件（用read_data命令）。而模型的创建，用第三方工具完成（比如matlab，python）。

lammps在windows下的安装问题

1、大规模原子分子并行模拟器。LAMMPS由美国Sandia国家实验室开发，以GPLlicense发布，即开放源代码且可以免费获取使用，这意味着使用者可以根据自己的需要自行修改源代码。

2、必须的，记住安装路径，编译lammps时要修改makefile.g++文件，需要用到fftw和mpich的路径。另外系统还要安装g++，或者，直接安装build-essential也行。fftw最好用2-5版本的，mpich也用2-5版本的。

3、各位前辈好，我使用的是 Makefile.mkl。

4、安装软件的时候改了路径。检查你的src目录下有没有安装程序，这个目录并不能被系统收入，如果还是不行就用sudosu，在这个权限下应该就没问题了。

lammps加载时闪退

如果加载过快，应变速率（strain rate）过快，现象也会不同；还有如果加载位置不好，材料会扭曲失稳，薄弱的点会被撕裂，这都会出现局部损坏。所以得把模型打出来看。

当然如果势能场也没问题的话，就有可能是加载边界条件问题了。可以看看模型及盒子是否匹配，周期还是有限边界，看看系统压强是不是过大或者过小。同时选择适当的时间步长，用thermostat时有没有同时开fix nve等也都可能引起问题。

请问lammps在ubuntu运行和在windows运行有什么不同?

1、win操作不透明，效率又低，我司用win2008和rhel5实测磁盘吞吐量差了30%。

2、主体不同 Lunix操作系统：是一套免费使用和自由传播的类UNIX操作系统。WINDS操作系统：是美国微软公司研发的一套操作系统。

3、这个问题说白了就是：windows和Linux的区别。两种操作系统内部构造不同，这很大程度上决定了软件的编写，编译的方式（这是不能运行的原因之一）。windows的闭源是“垄断”的关键。

4、区别3：文件格式不同 windows 操作系统内核是NT，而linux 是 shell；另外，windows 硬盘文件格式是fat32或NTSF，而linux 需要的文件格式是ext2或ext3，该操作系统还多一个SWAP格式的交换分区。

在windows中lammps输入命令的是哪个程序

1、可以，如果系统安装了mpich，lammps进行并行计算，多增加一个算例，计算时间就多一倍，如果是单线程的lammps，那么你可以算N（计算机核数或线程数）个算例而不影响速度。

2、】按下Win+R键，打开运行窗口，2】然后在“运行”对话框中输入“cmd”，3】最后按下回车键即可打开命令行窗口。

3、在“CMD命令提示符”内输入（类似Dos系统），下面给出打开CMD命令提示符的方法：所需材料：WIN7系统示例。首先点击桌面左下角的“开始菜单”（也可以直接按键盘上的WIN键打开开始菜单）。

4、”回车，输入“cd lammps”，然后按照手册上的说明输入“lmp_win_no-mpi -in in.colloid”就开始算了！（mpi后面姬钉灌固弑改鬼爽邯鲸有个空格！）如你还有别的问题，可另外向我求助；答题不易，互相理解，互相帮助。

5、在windows环境下，命令行程序为cmd.exe，是一个32位的命令行程序。微软Windows系统基于Windows上的命令解释程序，类似于微软的DOS操作系统。输入一些命令，cmd.exe可以执行，比如输入shutdown -s -t 30就会在30秒后关机。

6、首先我们打开电脑桌面，在电脑桌面上按下键盘上的WIN+R快捷键，即可调出运行窗口。然后我们在运行窗口中输入：CMD，回车确认输入，并执行输入内容。最后CMD命令行窗口模式就会打开了。

各位高手,怎么在windows下编译LAMMPS

现在已经可以再windows下运行LAMMPS的例子文件。

可以安装cygwin，Cygwin是一个在windows平台上运行的类UNIX模拟环境，是cygnus solutions公司开发的自由软件，搜索官网下载即可，下载完成，安装的时候注意记得安装相关语言的编译器、解释器，在cygwin中生成Linux可执行文件。

将一个实验用的in.colloid输入文件也放在lammps下，用以测试。

Windows下的cmd就是Windows的命令行终端，其中的一些命令和Ubuntu的有些许区别，不过在这个博客的范畴中没有涉及。Windows的环境变量，大概可以说是如果设置好了在path路径里面了，就可以直接在cmd命令行里直接调用程序。

文件显然不同。原因是ndk作为一个集成编译环境，制定了一套特定的规则用于生成最终的编译脚本。

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