go层级图用r语言怎么画，r语言ggplot绘图教程

R语言forestplot包画森林图挤成一坨,X轴也看不清,程序又该如何更改...

1、自从我使用了R语言的包，以前那些画亚组分析森林图的方法统统摒弃，画亚组分析森林图，唯R独尊。

2、●调整图形大小：你可以尝试调整图形的大小，使其在页面上更加合适。这可以通过调整graphwidth和graph.pos参数来实现。

R语言ggtree画圆形的树状图展示聚类分析的结果

http：//talgalili.github.io/dendextend/articles/dendextend.html 介绍的也是 dendextend 这个包的用法。

原理 本节绘制了一个二元聚类图以展示数据聚类的过程，我们首先安装和导入cluster算法包，然后使用clusplot函数绘制customer数据集的二元聚类图，clusplot函数的shade和color参数值均被设置成TRUE，得到一个彩色且带边框的聚类。

使用分层聚类分析。选择聚类类别，SPSSAU默认聚为三类。结合树状图进行分析，分层聚类出来，具体聚成几个类别较好，需要结合树状图结果及实际数据情况进行分析对比。

【R语言】解决GO富集分析绘图,标签重叠问题

最近有粉丝反映说，利用clusterProfiler这个包绘制GO富集分析气泡图和柱形图的时候，发现GO条目的名字都重叠在一起了。气泡图 柱形图 这个图别说美观了，简直不忍直视。经过我的认真研究，发现跟R版本有关。

其中2个与生长素信号转导相关，而另外8个则没注释到生长素信号转导相关，简单画一下，即 好，剩下的两个就不替换了。整体上，ORA模式的富集分析，本身就是经典的抽球案例，感兴趣的自行替换就可以了。

单细胞富集分析我最常用的是 分组GSVA ，但最近用到了GO分析，就复习一下GO和KEGG富集分析及绘图。载入无比熟悉的pbmc.3k数据集 (已注释好，数据准备见 monocle )pbmc3k数据集只有1个样本，没办法区分HC和病例组。

在是否需要构建的问题上，我看到徐洲更在 功能注释后如何做富集分析 中提到 “你不需要构建Orgdb，因为Orgdb的用途是进行基因编号和GO/KEGG的转换。

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